El Consejo de la Unión Europea o Consejo de Ministros, representa a los Estados miembros y está formado por los ministros de los gobiernos nacionales de las diferentes áreas. Es la principal instancia decisoria de la Unión y es el órgano legislativo superior, tiene en algunos ámbitos el poder ejecutivo. En él se trata de llegar a un acuerdo entre los intereses de los Estados miembros y los de la Unión. En esto y en la toma de decisiones por mayoría cualificada, se diferencia de una Conferencia Intergubernamental (CIG).
Comparte con el Parlamento Europeo la función legislativa y la presupuestaria y ejerce un papel fundamental en Política Exterior y de Seguridad Común (PESC) y la coordinación de las políticas económicas. El Consejo de Ministros estará compuesto por un representante de cada Estado miembro, con rango ministerial. Se pronunciará por mayoría cualificada excepto si el Tratado dispone otra cosa.